گروه‌بندی ژنوتیپ‌های برنج از لحاظ آهن، روی، منگنز و پروتئین دانه و سنجش کارایی نشانگرهای SSR پیوسته به آن‌ها

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 334

فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_PGRLU-5-2_006

تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1399

چکیده مقاله:

به‌‌‌نژادگران ‌‌در ‌‌راستا‌ی ‌‌انتخاب ‌‌بهترین ‌‌والدین ‌‌برای ‌‌تلاقی، ‌‌در ‌‌پی ‌‌ارقام ‌‌یا ‌‌ژنوتیپ‌هایی ‌‌هستند ‌‌که ‌‌از ‌‌نظر ‌‌ژنتیکی ‌‌از ‌‌هم ‌‌دور ‌‌باشند ‌‌که ‌‌می‌توان ‌‌از ‌‌طریق ‌‌بررسی ‌‌فاصله‌ی ‌‌بین ‌‌ژنوتیپ‌ها ‌‌با ‌‌استفاده ‌‌از ‌‌تجزیه ‌‌خوشه‌ای ‌‌به ‌‌این ‌‌هدف ‌‌دست ‌‌یافت. ‌‌پژوهش ‌‌حاضر ‌‌با ‌‌هدف ‌‌گروه‌بندی ‌‌50 ‌‌ژنوتیپ ‌‌برنج ‌‌هوازی ‌‌و ‌‌غرقابی ‌‌براساس ‌‌خصوصیات ‌‌بیوشیمایی ‌‌از ‌‌جمله ‌‌میزان ‌‌آهن، ‌‌روی، ‌‌منگنز ‌‌و ‌‌پروتئین ‌‌دانه ‌‌و ‌‌نشانگر‌های ‌‌DNA ‌‌پیوسته ‌‌به ‌‌آن‌ها ‌‌انجام ‌‌شد. ‌‌براساس ‌‌نتایج ‌‌تجزیه ‌‌خوشه‌ای ‌‌به ‌‌روش ‌‌Ward ‌‌ژنوتیپ‌های ‌‌مورد ‌‌مطالعه ‌‌در ‌‌چهار ‌‌گروه ‌‌قرار ‌‌گرفتند.گروه ‌‌سوم ‌‌به ‌‌عنوان ‌‌کوچک‌ترین ‌‌گروه ‌‌با ‌‌سه ‌‌ژنوتیپ ‌‌(IR82635-B-B-82-2، ‌‌Caiapo ‌‌و ‌‌گوهر)، ‌‌برای ‌‌تمام ‌‌متغیرها ‌‌بویژه ‌‌عناصر ‌‌مورد ‌‌بررسی ‌‌بالاترین ‌‌مقدار ‌‌را ‌‌به ‌‌خود ‌‌اختصاص ‌‌دادند. ‌‌میانگین ‌‌میزان ‌‌آهن، ‌‌روی، ‌‌منگنز ‌‌و ‌‌پروتئین ‌‌این ‌‌گروه ‌‌بترتیب ‌‌32.39، ‌‌34.15، ‌‌25.66 ‌‌میلی‌گرم ‌‌در ‌‌کیلوگرم ‌‌و ‌‌6.71 ‌‌درصد ‌‌بدست ‌‌آمد. ‌‌از ‌‌سوی ‌‌دیگر ‌‌براساس ‌‌اطلاعات ‌‌مولکولی ‌‌نشانگرهای ‌‌ریزماهواره ‌‌که ‌‌بر ‌‌اساس ‌‌مطالعات ‌‌مکان‌یابی ‌‌QTL، ‌‌مرتبط ‌‌با ‌‌عناصر ‌‌مذکور ‌‌شناسایی ‌‌شده ‌‌بودند، ‌‌ژنوتیپ‌‌‌ها ‌‌به ‌‌دو ‌‌گروه ‌‌بزرگ ‌‌تقسیم ‌‌شدند. ‌‌به ‌‌طوری‌‌‌که ‌‌قسمت ‌‌اعظم ‌‌ژنوتیپ‌‌‌های ‌‌برنج ‌‌غیربومی ‌‌و ‌‌هوازی ‌‌در ‌‌گروه ‌‌مجزایی ‌‌قرار ‌‌گرفتند. ‌‌میزان ‌‌همبستگی ‌‌ماتریس ‌‌فاصله ‌‌اقلیدوسی ‌‌بین ‌‌ژنوتیپ‌‌‌ها ‌‌از ‌‌لحاظ ‌‌میزان ‌‌عناصر ‌‌و ‌‌پروتئین ‌‌و ‌‌ماتریس ‌‌تشابه ‌‌ژنتیکی ‌‌بر ‌‌اساس ‌‌اطلاعات ‌‌نشانگرهای ‌‌ریزماهواره ‌‌(Nei) ‌‌با ‌‌آزمون ‌‌همبستگی ‌‌منتل ‌‌در ‌‌سطح ‌‌احتمال ‌‌یک ‌‌درصد ‌‌معنی‌‌‌دار ‌‌برآورد ‌‌شد ‌‌که ‌‌می‌‌‌تواند ‌‌دلیلی ‌‌بر ‌‌اعتبار ‌‌پیوستگی ‌‌ژنتیکی ‌‌این ‌‌نشانگرها ‌‌با ‌‌نواحی ‌‌ژنومی ‌‌کنترل ‌‌کننده ‌‌این ‌‌عناصر ‌‌در ‌‌جمعیت ‌‌حاضر ‌‌باشد. 

نویسندگان

الهام نصیری

Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan

عاطفه صبوری

Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan, Rasht, Iran

اکبر فرقانی

Department of Soil Science, Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan

مسعود اصفهانی

Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Aboutalebi, Sh., Fotokian, M.H. and Zeinalabedini, M. )2015(. Evaluation of ...
  • Alvanchi, M. )2013(. Evaluation of Rice (Oryza sativa L.) Genotypes ...
  • Anuradha, K., Agarwal, S., Rao, Y.V., Rao, K.V., Viraktamath, B.C. ...
  • Brar, D.S., Mackill, D.J. and Hardy, B. )2007(. Rice genetics ...
  • Dadras, A.R., Samizadeh, H. and Sabouri, H. )2015(. Evaluation and ...
  • FAO. )2004(. Food and Agriculture Organization of the United Nations, ...
  • Fitzgerald, M.A., McCouch, S.R. and Hall, R.D. )2008(. Not just ...
  • Ghandilyan, A., Vreugdenhilb, D. and Aarts, M.G.M. )2006(. Progress in ...
  • Gheitaran Poorsahrigh, Sh., Mohammadi, S.A., Sadeghzadeh, B. (2014). Identification of ...
  • Honarvar, F., Sabouri, H., Dadras, A.R. and Saieedisar, S. )2013(. ...
  • Honarvar, F., Sabouri, H. and Dadras, A.R. )2016(. Study of ...
  • Indurkar, A.B., Majgahe, S.K., Sahu, V.K., Vishwakarma, A., Premi, V., ...
  • Kalra, Y.P. )1998(. Handbook of Reference Methods for Plant Analysis. ...
  • Lu, K., Li, L., Zheng, X., Zhang, Z., Mou, Y. ...
  • Moumeni, A., Emanykhah, F., Maleki Zanjani, B. and Maleki, S. ...
  • Nicholas, F.W. (2006). Discovery, validation, and delivery of DNA markers. ...
  • Pathak, Kh., Rahman, S.W., Bhagawati, S. and Gogoi, B. )2017(. ...
  • Rashidi, V., Majidi, I., Mohamadi, S.A. and Moghadam Vahed M. ...
  • Romesburg, H.C. )1990(. Cluster Analysis for Researchers, 1th end. Krieger ...
  • Saghai Maroof, M.A., Biyashev, R.M., Yang, G.P., Zhang, Q. and ...
  • Shi, C.H., Zhu. J. and Wu, J.G. )1999(. Analysis of ...
  • Stangoulis, A.J. )2010(. Technical aspects of zinc and iron analysis ...
  • Stangoulis, J.C.R., Huynh, B., Welch, R.M., Choi, E.Y. and Graham, ...
  • Swamy, B.P.M., Kaladhar, K., Anuradha, K., Batchu, A.K., Longvah, T., ...
  • Yasmin, F., Islam, M.R., S. Rehana, Mazumder, R.R., Anisuzzaman, M., ...
  • Zeng, Y., Zhang, H., Wang, L., Pu, X., Du, J., ...
  • نمایش کامل مراجع